More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0535 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  85.99 
 
 		 307 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  75.9 
 
 		 307 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  69.38 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  63.23 
 
 		 312 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  61.33 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  62.3 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  58.67 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  58.67 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  68.56 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  64.57 
 
 		 308 aa  346  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  61.74 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  61.51 
 
 		 317 aa  345  8e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  63.58 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  58.63 
 
 		 307 aa  341  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.67 
 
 		 311 aa  341  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.48 
 
 		 307 aa  340  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 307 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.23 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  59 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  56.81 
 
 		 307 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.67 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  61.87 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  60.86 
 
 		 317 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  62.75 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  61.54 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  61.54 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  60.54 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  60.87 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  60.54 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  58.28 
 
 		 304 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  60.87 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  60.07 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.09 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.76 
 
 		 309 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 309 aa  328  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.93 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  64.09 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  52.73 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  59.74 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  60.4 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  60.4 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  59.27 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  59.41 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  60 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  59.46 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  59.08 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.39 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  56.91 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  59.08 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  60.6 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  55.41 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  56.76 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  59.08 
 
 		 308 aa  318  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  52.48 
 
 		 304 aa  318  7e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  58.76 
 
 		 291 aa  318  9e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  58.94 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  54.67 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.13 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  56.58 
 
 		 302 aa  316  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  51.32 
 
 		 304 aa  315  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  54.28 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  58.08 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.94 
 
 		 308 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  59.08 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  59.08 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  59.8 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59.74 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  54.49 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.94 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  57.93 
 
 		 309 aa  311  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  58.09 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  54.82 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  54.28 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  51.16 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.86 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  55.81 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>