96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0428 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  700    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  72.11 
 
 		 344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  64.85 
 
 		 343 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  64.29 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  61.79 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  58.58 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  62.69 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  62.69 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  62.5 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  60.49 
 
 		 351 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  58.58 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  58.19 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  59.57 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  59.57 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  56.43 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  59.38 
 
 		 334 aa  391  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  55.16 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  59.32 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  58.59 
 
 		 331 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  51.61 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  54.05 
 
 		 342 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  52.58 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  52.92 
 
 		 350 aa  340  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  49.27 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  49.7 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  48.2 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  52 
 
 		 369 aa  322  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  47.49 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  48.63 
 
 		 333 aa  315  9e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  50.32 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  50.16 
 
 		 342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  50.82 
 
 		 336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  46.06 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  47.21 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  49.35 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  48.28 
 
 		 344 aa  295  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  48.05 
 
 		 354 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  48.38 
 
 		 342 aa  295  8e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  46.2 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  46.2 
 
 		 341 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  46.97 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  44.34 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  46.56 
 
 		 356 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  44.34 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  48.71 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  42.86 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  46.71 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  49.82 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  45.9 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  43.61 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  41.1 
 
 		 334 aa  252  8.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  43.03 
 
 		 334 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  41.59 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  43.52 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.86 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  51.08 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  43.53 
 
 		 256 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  34.21 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  63.3 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  58.77 
 
 		 197 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  56 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  52.63 
 
 		 144 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  50.36 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  50 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  50 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  46.83 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  43.24 
 
 		 192 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  46.46 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  46.83 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  40.94 
 
 		 210 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  48.72 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  49.55 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  54.55 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  48.78 
 
 		 141 aa  109  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  41.32 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  49.14 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  49.57 
 
 		 126 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  43.97 
 
 		 198 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  34.2 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  34.2 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  41.23 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  33.56 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  55.56 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  39.22 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  40 
 
 		 117 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  40.96 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  37.35 
 
 		 90 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  39.47 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  46.3 
 
 		 81 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  42.59 
 
 		 55 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  38.78 
 
 		 88 aa  46.2  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  30.88 
 
 		 81 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  46.51 
 
 		 77 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>