More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6389 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6389  luciferase family protein  100 
 
 		 298 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4790  luciferase-like protein  56.03 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  47.46 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1652  Luciferase-like monooxygenase  38.81 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0921038  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5156  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  48.04 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0900  luciferase-like protein  40.28 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3462  Luciferase-like, subgroup  37.89 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  33.57 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  33.46 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.62 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  34.01 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2353  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.74 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1583  luciferase family protein  35 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  32.86 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.53 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.17 
 
 		 277 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  38.98 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  33.67 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  34.97 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.98 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  35.85 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  35.85 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  35.85 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  32.08 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.16 
 
 		 305 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.71 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.98 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  39.2 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.63 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.13 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  34.23 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  32.55 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  29.02 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.71 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.53 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  34.18 
 
 		 342 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  38.65 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  39.38 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  37.58 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  36.97 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.93 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  35.85 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  35.57 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.57 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  37.06 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.5 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  38.79 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  34.39 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.71 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  36.18 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  37.29 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  38.51 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  37.22 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  34.59 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  35.14 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  30 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.74 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  30 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  38.54 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.91 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  31.15 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  31.82 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.87 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  32.49 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.34 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  38.6 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  35.26 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  35.26 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  35.26 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  39.58 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.17 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.57 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.66 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  39.64 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.28 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  40.16 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  38.71 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.95 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  37.58 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  35.39 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  32.68 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  40.21 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  35.93 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  32.97 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  37.97 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0336  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.61 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.95 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  35.2 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  29.95 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>