More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6258 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6258  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  530  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.434452  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4157  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 
275 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4569  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.83 
 
 
277 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572506  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.54 
 
 
273 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.54 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3613  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.54 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.95 
 
 
271 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
259 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
258 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
259 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
257 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6335  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 
258 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
258 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
258 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
260 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
262 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
259 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
266 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
264 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
259 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
261 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
258 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
257 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
258 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
265 aa  121  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
260 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
797 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
254 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  32.56 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
249 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4646  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
259 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
261 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
259 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  31.73 
 
 
289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  31.64 
 
 
260 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
257 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
261 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
260 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
257 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>