More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5892 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
476 aa  961    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  76.99 
 
 
472 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 
366 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  50.82 
 
 
335 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 
307 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
318 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
300 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 
337 aa  93.6  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
355 aa  90.9  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 
1340 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  42.86 
 
 
320 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  34.64 
 
 
323 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
841 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
836 aa  84  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.43 
 
 
348 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  29.44 
 
 
358 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
352 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 
822 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  37.7 
 
 
652 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  35.94 
 
 
1119 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  33.11 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  48.05 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 
306 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
312 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
841 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.22 
 
 
838 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.06 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  38.71 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  40.7 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
312 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
321 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  33.9 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  31.67 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  25.13 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.07 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  35.29 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  41.24 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
293 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.48 
 
 
2401 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
1267 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
1267 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
1523 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
308 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
334 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
333 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
319 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
311 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  30.77 
 
 
262 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
342 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
312 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
339 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>