29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5217 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  34.39 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  34.04 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  36.31 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 648 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1052 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 674 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  41.43 
 
 		 329 aa  96.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  27.59 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  35.33 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  33.04 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  34 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  32.3 
 
 		 668 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1440  RNA binding S1 domain protein  28.19 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  34.19 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1393  Appr-1-p processing domain protein  32.76 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.172023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  32.54 
 
 		 252 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  35.71 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  28.47 
 
 		 158 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  27.97 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  26.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  26.4 
 
 		 277 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  28.57 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  29.84 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1463  hypothetical protein  30.39 
 
 		 635 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  26.05 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>