More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4922 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  100 
 
 		 518 aa  1004    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  54.25 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  53.16 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  54.72 
 
 		 482 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  53.63 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  54.13 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  56.09 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  54.51 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  54.45 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  54.18 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  51.77 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  49.35 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  49.44 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  49.16 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  48.84 
 
 		 449 aa  329  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  49.78 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  49.78 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  50.23 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  49.17 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  32.33 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  33.99 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  33.63 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  29.44 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.04 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  27.78 
 
 		 428 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.19 
 
 		 879 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.74 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.61 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.02 
 
 		 419 aa  210  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  38.53 
 
 		 425 aa  210  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  28 
 
 		 428 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.99 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.99 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.08 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  31.67 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.36 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.49 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  36.43 
 
 		 896 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  32.86 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.37 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.93 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.21 
 
 		 415 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  33.89 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.3 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  30.63 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 878 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  37.32 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.6 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.13 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.81 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.13 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  32.55 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.57 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.54 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.78 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.58 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  32.14 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.64 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.14 
 
 		 393 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.32 
 
 		 433 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.94 
 
 		 417 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.05 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.39 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.78 
 
 		 412 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  33.02 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.26 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.1 
 
 		 415 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.12 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.22 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.88 
 
 		 412 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.05 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.87 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.32 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.94 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.72 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  31.5 
 
 		 410 aa  195  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.81 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.24 
 
 		 880 aa  194  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.94 
 
 		 885 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.86 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.86 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  32.24 
 
 		 430 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.75 
 
 		 572 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  32.2 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.04 
 
 		 416 aa  193  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.83 
 
 		 414 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.81 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  36.69 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.96 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.24 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  33.8 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 394 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.32 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.36 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  33.25 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.25 
 
 		 644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>