More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4670 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4670  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
418 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.87 
 
 
403 aa  353  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.29 
 
 
410 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  46.12 
 
 
409 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.61 
 
 
417 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.88 
 
 
458 aa  325  6e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.69 
 
 
409 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  44.7 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.46 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 
422 aa  318  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.63 
 
 
385 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  43.39 
 
 
418 aa  315  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.56 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
381 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
381 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.17 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.78 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.55 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.05 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.58 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.03 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.19 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.94 
 
 
411 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.36 
 
 
440 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.07 
 
 
381 aa  299  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.38 
 
 
378 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.37 
 
 
380 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  44.33 
 
 
427 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.06 
 
 
381 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.49 
 
 
388 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.69 
 
 
381 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  40.81 
 
 
386 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.53 
 
 
382 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  42.09 
 
 
383 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.41 
 
 
379 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.37 
 
 
383 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.5 
 
 
397 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  41.55 
 
 
383 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.21 
 
 
381 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.05 
 
 
410 aa  290  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.33 
 
 
401 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.8 
 
 
381 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.8 
 
 
381 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0085  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.53 
 
 
382 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.8 
 
 
381 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.9 
 
 
381 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.23 
 
 
390 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.97 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.28 
 
 
403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.3 
 
 
391 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.22 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.8 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.47 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.28 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.02 
 
 
402 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.27 
 
 
383 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.63 
 
 
357 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.6 
 
 
405 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  42.18 
 
 
394 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.95 
 
 
386 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.84 
 
 
385 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  42.9 
 
 
392 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.72 
 
 
385 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.13 
 
 
382 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  36.41 
 
 
381 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.94 
 
 
382 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  41.82 
 
 
386 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  39.01 
 
 
387 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.01 
 
 
387 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.5 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  41.55 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  41.55 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  41.55 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  38.2 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.87 
 
 
387 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  40.75 
 
 
386 aa  272  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.95 
 
 
414 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.89 
 
 
387 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.26 
 
 
399 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.99 
 
 
391 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 
380 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  42.51 
 
 
440 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  42.51 
 
 
440 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.6 
 
 
415 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  42.51 
 
 
412 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  42.51 
 
 
412 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  42.51 
 
 
412 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  40.21 
 
 
379 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  42.51 
 
 
412 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  42.25 
 
 
440 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.46 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.18 
 
 
379 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0468  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.96 
 
 
390 aa  266  5e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000798916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  40.94 
 
 
378 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0579  FMN-dependent dehydrogenase  42.51 
 
 
412 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1229  L-lactate dehydrogenase  40.86 
 
 
380 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0499523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1750  L-lactate dehydrogenase  40.86 
 
 
380 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0415  L-lactate dehydrogenase  40.86 
 
 
380 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.596015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1563  L-lactate dehydrogenase  40.86 
 
 
380 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>