More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4634 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4634  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 557 aa  1113    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  37.08 
 
 		 550 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 		 550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  36.73 
 
 		 552 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  36.98 
 
 		 544 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  34.93 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 552 aa  329  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  34.56 
 
 		 549 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.58 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  35.77 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 549 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  36.3 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 547 aa  316  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  35.03 
 
 		 552 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  36.13 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  35.23 
 
 		 568 aa  309  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  35.66 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 549 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 549 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  35.35 
 
 		 549 aa  306  6e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 563 aa  303  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 554 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.73 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  35.15 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  33.82 
 
 		 548 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  36.19 
 
 		 564 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  34.56 
 
 		 560 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  36.02 
 
 		 561 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.94 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  33.76 
 
 		 550 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 566 aa  287  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 562 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.99 
 
 		 560 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.81 
 
 		 560 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  34.66 
 
 		 575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  35.83 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  34.48 
 
 		 575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  34.12 
 
 		 575 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 557 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  34.59 
 
 		 575 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  33.94 
 
 		 575 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.27 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 843 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  34.8 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 566 aa  280  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  35.1 
 
 		 547 aa  280  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  34.23 
 
 		 575 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  34.23 
 
 		 575 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  32.25 
 
 		 565 aa  279  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 630 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.94 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 566 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  34.62 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  34.62 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  34.91 
 
 		 538 aa  276  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  32.19 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  32.74 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  32.79 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  32.97 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  32.97 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  32.97 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  32.36 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 578 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  34.42 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  34.42 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 571 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  34.32 
 
 		 565 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  34 
 
 		 571 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  34.75 
 
 		 576 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 576 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  34.24 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  34.24 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  34.24 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 577 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.82 
 
 		 828 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  34.24 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  34.19 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 566 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  34.23 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  33.02 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  31.89 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  31.71 
 
 		 570 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 578 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  34.19 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 576 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 532 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  34.1 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 564 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.2 
 
 		 538 aa  267  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>