More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3937 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  100 
 
 		 430 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  77.08 
 
 		 433 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  81.18 
 
 		 444 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  67.38 
 
 		 435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  67.61 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  67.61 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  67.85 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  67.53 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  65.64 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  64.55 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  64.55 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  64.55 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  56.88 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  54.8 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  54.57 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  55.21 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  55.21 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  55.21 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  52.97 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  52.97 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  52.97 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  53.52 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  51.53 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  50.82 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  51.06 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  51.06 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  51.06 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  33.57 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  33.33 
 
 		 406 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  33.33 
 
 		 406 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  32.85 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.33 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.22 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.17 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.16 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.33 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  30.91 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  31.08 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.55 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.07 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0702  hypothetical protein  53.16 
 
 		 189 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.83 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.83 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.83 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.79 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.76 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.6 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  32.19 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.13 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.07 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  30.33 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  34.26 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  30.33 
 
 		 422 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.43 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.31 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  32.63 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.67 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  31.16 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.65 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  31.2 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.68 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  30.5 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  31.2 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.9 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  31.2 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.57 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  32.24 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  30.89 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  29.01 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.4 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  31.23 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  29.72 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  32.68 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  27.64 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  30.73 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.06 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  28.74 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.62 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.62 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  32.72 
 
 		 421 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.26 
 
 		 401 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  30.75 
 
 		 394 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  30.75 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.32 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.12 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.1 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  30.52 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.32 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  31.27 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  28.89 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  26.81 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.38 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.32 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.26 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  30.18 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  30.7 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1995  cytochrome P450  31.12 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.29 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.38 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>