More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3692 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3937  cytochrome P450  77.08 
 
 		 430 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  100 
 
 		 433 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4689  cytochrome P450  76.91 
 
 		 444 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  68.87 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  68.87 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  69.1 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  68.63 
 
 		 435 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  68.87 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  67.45 
 
 		 426 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  66.67 
 
 		 423 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  66.67 
 
 		 423 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  66.67 
 
 		 423 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0597  cytochrome P450  59.07 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  57.27 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  56.94 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  57.41 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  55.4 
 
 		 426 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  55.4 
 
 		 426 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  55.4 
 
 		 426 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  54.33 
 
 		 423 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  54.33 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  54.33 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0332  cytochrome P450  53.74 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0321  cytochrome P450  53.74 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0342  cytochrome P450  53.74 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.241654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5170  cytochrome P450  52.8 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1587  cytochrome P450  51.28 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.08 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.56 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3475  cytochrome P450  32.47 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218567  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  33.33 
 
 		 398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  32.46 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0702  hypothetical protein  58.39 
 
 		 189 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.08 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  30.34 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.13 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  32.72 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  34.34 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3422  cytochrome P450  31.98 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3485  cytochrome P450  31.98 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73343  normal  0.148446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.73 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3433  cytochrome P450  31.74 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  32.29 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.37 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  34.98 
 
 		 398 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  32.77 
 
 		 413 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3781  cytochrome P450  31.19 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  31.57 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  31.57 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.57 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.38 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  31.77 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  32.93 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2702  cytochrome P450 CYP109C2  32.45 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  32.93 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  31.77 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  31.77 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  32.93 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  30.1 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  35.68 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.67 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.21 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  30.22 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  32.74 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  31.04 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.02 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  32.15 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  30.24 
 
 		 406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  30.24 
 
 		 406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  30.41 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.38 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.72 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  32.93 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  31.89 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  31.89 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.45 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  31.89 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  32.91 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  31.77 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.14 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  29.38 
 
 		 783 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  28.57 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  32.37 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.37 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  37.29 
 
 		 357 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  30.99 
 
 		 393 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  29.05 
 
 		 782 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.81 
 
 		 417 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.37 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  29.54 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.27 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  30.95 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  31.39 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.62 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  29.86 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  29.9 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.85 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  29.3 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  29.3 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.2 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>