More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2374 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2374  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
533 aa  1059    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2872  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  74.73 
 
 
561 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.102568  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6477  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  68 
 
 
511 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140482  normal  0.0817062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2176  aldehyde dehydrogenase  65.71 
 
 
501 aa  620  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2925  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  63.05 
 
 
530 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.739549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2249  Aldehyde Dehydrogenase  60.19 
 
 
529 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408136  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1373  Aldehyde Dehydrogenase  46.5 
 
 
529 aa  415  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.586199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2080  Aldehyde Dehydrogenase  45.67 
 
 
530 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.38 
 
 
493 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
498 aa  349  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.2 
 
 
499 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.24 
 
 
500 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.08 
 
 
493 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.26 
 
 
496 aa  329  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 
516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
503 aa  323  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.93 
 
 
493 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
497 aa  319  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.9 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  39.8 
 
 
496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
505 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  35.69 
 
 
496 aa  289  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
480 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  38.87 
 
 
496 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
496 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
496 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  37.03 
 
 
496 aa  256  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
496 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
478 aa  253  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
529 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.82 
 
 
496 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  36.61 
 
 
509 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
477 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  34.62 
 
 
509 aa  246  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
513 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  39.51 
 
 
529 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 
509 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  39.51 
 
 
529 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  34.03 
 
 
480 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  40.51 
 
 
515 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  33.47 
 
 
506 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  33.47 
 
 
506 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  34.78 
 
 
480 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 
514 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  34.52 
 
 
478 aa  240  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  38.3 
 
 
504 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  34.61 
 
 
498 aa  240  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  39.43 
 
 
530 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 
496 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
479 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
522 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  33.98 
 
 
483 aa  238  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
503 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  38.48 
 
 
482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  34.76 
 
 
477 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
494 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
494 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  35.6 
 
 
513 aa  236  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
482 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  39.87 
 
 
494 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  34.47 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  32.4 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  35.61 
 
 
446 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  37.58 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  37.58 
 
 
510 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 
506 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  34.66 
 
 
483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.92 
 
 
502 aa  233  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
535 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
535 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
535 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
503 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
535 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
505 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
535 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
503 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
503 aa  233  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.28 
 
 
503 aa  233  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  37.59 
 
 
502 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  33.83 
 
 
477 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
503 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
507 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  32.3 
 
 
484 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  32.78 
 
 
481 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
507 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3451  aldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
503 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208347  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  34.47 
 
 
477 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 
516 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  35.61 
 
 
581 aa  231  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0498  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
511 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
478 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  34.35 
 
 
476 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  33.4 
 
 
517 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
479 aa  230  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
503 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 
510 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>