More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6477 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2249  Aldehyde Dehydrogenase  67.95 
 
 
529 aa  657    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408136  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6477  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  100 
 
 
511 aa  1038    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140482  normal  0.0817062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2176  aldehyde dehydrogenase  84.15 
 
 
501 aa  814    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2925  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.87 
 
 
530 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.739549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2872  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.1 
 
 
561 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.102568  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2374  aldehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
533 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1373  Aldehyde Dehydrogenase  47.73 
 
 
529 aa  457  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.586199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2080  Aldehyde Dehydrogenase  46.83 
 
 
530 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 
498 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  42.57 
 
 
493 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 
493 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 
499 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.4 
 
 
496 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.34 
 
 
500 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.67 
 
 
516 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
497 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 
503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  41.12 
 
 
498 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.64 
 
 
493 aa  359  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.17 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
505 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
480 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
513 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
496 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
494 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 
494 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  36.58 
 
 
484 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  36.59 
 
 
509 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
482 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  38.4 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
496 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  37.39 
 
 
510 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  40.71 
 
 
529 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  40.71 
 
 
529 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
513 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  35.43 
 
 
509 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  37.39 
 
 
510 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 
496 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  36.84 
 
 
581 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
535 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
535 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
535 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
481 aa  262  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
535 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
535 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  37.71 
 
 
504 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
503 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  36.91 
 
 
496 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.9 
 
 
503 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
503 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  35.85 
 
 
477 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
503 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
510 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  33.26 
 
 
506 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  36.72 
 
 
483 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37 
 
 
496 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
502 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.29 
 
 
483 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.29 
 
 
483 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.29 
 
 
483 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  33.26 
 
 
506 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  40.62 
 
 
530 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.08 
 
 
483 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.72 
 
 
483 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
480 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  35.21 
 
 
477 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.51 
 
 
483 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.08 
 
 
483 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  34.57 
 
 
477 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  36.65 
 
 
502 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  37.01 
 
 
522 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
510 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  34.78 
 
 
498 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.29 
 
 
483 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
513 aa  258  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  39.48 
 
 
515 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.08 
 
 
483 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.29 
 
 
483 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  34.43 
 
 
501 aa  257  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
497 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  34.9 
 
 
476 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  34.94 
 
 
483 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  37.2 
 
 
482 aa  257  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
517 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 
475 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.08 
 
 
483 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
529 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.18 
 
 
503 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  34.85 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  34.45 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  34.19 
 
 
479 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>