More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0218 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0218  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 241 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4363  putative integral membrane protein  71.89 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  48.96 
 
 		 207 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  38.81 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  38.54 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  38.83 
 
 		 259 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  35.75 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  42.59 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  39.76 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  35.94 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  38.12 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  35.9 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.86 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.14 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  35.48 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.48 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  35.23 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  38.95 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  35.83 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.37 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  40.7 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  37.8 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  35.29 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.82 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  40.2 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  40.2 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  40.2 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  35 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  40.2 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  40.2 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  40.2 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.93 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  40.2 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  38.95 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  34.58 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  34.95 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.96 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  34.95 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  36.84 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  37.84 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  40.2 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  40.96 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  33.16 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  34.44 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  34.41 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  34.94 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  34.68 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.02 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  35.53 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  34.27 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  36.87 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  36.31 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  37.77 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.99 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  33.15 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  39.49 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  33.85 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  36.13 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  34.16 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  34.16 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  38.17 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  37.69 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  34.16 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  36.13 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  36.22 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.71 
 
 		 458 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  33.67 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  37.06 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  38.98 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  35.6 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.68 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  35.84 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  34.57 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>