26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3691 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3691  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  75.63 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  36.69 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  38.99 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  32.47 
 
 		 680 aa  62  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  34.84 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  26.9 
 
 		 817 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.38 
 
 		 435 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2641  hypothetical protein  32.62 
 
 		 298 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.849671  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  33.54 
 
 		 363 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  33.71 
 
 		 408 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  36.25 
 
 		 441 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  29.73 
 
 		 420 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  28.26 
 
 		 325 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  36.36 
 
 		 498 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  33.33 
 
 		 427 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  36.36 
 
 		 452 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  31.03 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  31.29 
 
 		 431 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  27.34 
 
 		 757 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  31.86 
 
 		 418 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  32.05 
 
 		 497 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  32.47 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.47 
 
 		 510 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  29.74 
 
 		 394 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>