89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2545 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2545  PfkB  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0899  PfkB  65.49 
 
 		 310 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1993  ribokinase-like domain-containing protein  39.62 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291492  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0911  PfkB domain protein  28.1 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0885  PfkB domain protein  27.55 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.51 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  28.33 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  27.02 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  27.85 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  26.61 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  26.61 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  26.61 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  33.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  33.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  33.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  33.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  26.61 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  36.36 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  29.28 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  27.2 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  28.81 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  32.65 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  29.45 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  34.48 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  34.48 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  34.48 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  22.7 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  34.48 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  25.76 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  32.89 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  31.18 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  26.21 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  28.83 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2311  ribokinase-like domain-containing protein  36.49 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  30.26 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  31.29 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.32 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.36 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  25.6 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.28 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  27.09 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  23.53 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  33.59 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  25.81 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  38.24 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  26.24 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  25.48 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  33.64 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  26.24 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  26.51 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  24.71 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  28.69 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  25.88 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  24.79 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  27.39 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  27.39 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  27.39 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  25.86 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  21.89 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  25.3 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  35.53 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  32.68 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  27.27 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  25.86 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  28.11 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  38.82 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  27.35 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  21.43 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  23.39 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  27.27 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  27.27 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  27.27 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.82 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  24.06 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  27.43 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  27.72 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>