More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2173 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  54.5 
 
 		 638 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  54.5 
 
 		 638 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  53.81 
 
 		 658 aa  682    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  55.66 
 
 		 637 aa  691    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  57.72 
 
 		 636 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  53.4 
 
 		 640 aa  666    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  55.31 
 
 		 646 aa  676    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21861  molecular chaperone DnaK  57.7 
 
 		 630 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.357564  normal  0.686332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  56.04 
 
 		 641 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  52.98 
 
 		 640 aa  657    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  54.53 
 
 		 611 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  55.7 
 
 		 623 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  56.19 
 
 		 637 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  52.54 
 
 		 639 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1476  molecular chaperone DnaK  52.48 
 
 		 647 aa  636    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  51.77 
 
 		 644 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  51.93 
 
 		 644 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4730  chaperone protein DnaK  57.83 
 
 		 682 aa  666    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  54.5 
 
 		 645 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  55.8 
 
 		 613 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  57.39 
 
 		 630 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  53.67 
 
 		 634 aa  635    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  52.85 
 
 		 639 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  57.28 
 
 		 630 aa  690    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  63.28 
 
 		 629 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  60.4 
 
 		 633 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0919  molecular chaperone DnaK  58.82 
 
 		 688 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.628241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  55.26 
 
 		 640 aa  679    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  53 
 
 		 638 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  53.03 
 
 		 636 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  56.77 
 
 		 634 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  56.32 
 
 		 637 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  59.08 
 
 		 639 aa  722    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  58.05 
 
 		 637 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  57.75 
 
 		 637 aa  724    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  57.72 
 
 		 638 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  56.57 
 
 		 637 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  52.23 
 
 		 638 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  51.71 
 
 		 628 aa  647    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  56.48 
 
 		 645 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  59.62 
 
 		 634 aa  749    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2580  molecular chaperone DnaK  62.3 
 
 		 749 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  52.7 
 
 		 644 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  55.99 
 
 		 639 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  56.86 
 
 		 612 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  62.11 
 
 		 632 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  59.45 
 
 		 609 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2173  molecular chaperone DnaK  100 
 
 		 641 aa  1267    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  59.45 
 
 		 616 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  55.38 
 
 		 633 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  54.02 
 
 		 635 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  53.58 
 
 		 635 aa  637    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  57.48 
 
 		 634 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  56.66 
 
 		 643 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  56.95 
 
 		 632 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  54.24 
 
 		 640 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1182  molecular chaperone DnaK  53.22 
 
 		 638 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  52.67 
 
 		 620 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  53.91 
 
 		 633 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  57.28 
 
 		 632 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19141  molecular chaperone DnaK  56.48 
 
 		 635 aa  729    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  58.31 
 
 		 644 aa  694    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2076  molecular chaperone DnaK  56.12 
 
 		 629 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000834222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  53.64 
 
 		 642 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  55.46 
 
 		 643 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  58.64 
 
 		 634 aa  683    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  57.71 
 
 		 622 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  62.87 
 
 		 636 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  51.39 
 
 		 639 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  55.38 
 
 		 636 aa  691    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  53.12 
 
 		 632 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  56.38 
 
 		 619 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  54.13 
 
 		 619 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  53.72 
 
 		 635 aa  651    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  60 
 
 		 638 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4012  molecular chaperone DnaK  57.38 
 
 		 670 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  52.68 
 
 		 639 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  52.68 
 
 		 639 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  53.31 
 
 		 671 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0969  molecular chaperone DnaK  53.31 
 
 		 638 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  62.28 
 
 		 623 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  53.97 
 
 		 610 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  53.59 
 
 		 636 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  53.1 
 
 		 637 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  66.98 
 
 		 631 aa  837    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  54.28 
 
 		 641 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  58.93 
 
 		 653 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  52.68 
 
 		 639 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  59.28 
 
 		 618 aa  678    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  56.43 
 
 		 626 aa  665    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  56.77 
 
 		 636 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  56.73 
 
 		 640 aa  700    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  52.4 
 
 		 638 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  56.61 
 
 		 621 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2511  molecular chaperone DnaK  54.24 
 
 		 637 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  57.71 
 
 		 622 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0775  molecular chaperone DnaK  55.7 
 
 		 623 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.175007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  58.41 
 
 		 622 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3362  molecular chaperone DnaK  51.76 
 
 		 641 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00483084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  54.98 
 
 		 636 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>