245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1301 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 350 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.93 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.57 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  26.6 
 
 		 313 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1077  putative glycosyltransferase  29.78 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 250 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 270 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3040  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.679384  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0274  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3882  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.38 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 257 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.17 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6295  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3832  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0566  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1591  family 2 glycosyl transferase  29.35 
 
 		 281 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 255 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  39.49 
 
 		 256 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  27.76 
 
 		 231 aa  98.2  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  31.7 
 
 		 249 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 253 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 		 257 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 		 257 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.39 
 
 		 254 aa  96.3  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  34.39 
 
 		 254 aa  96.3  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 272 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.94 
 
 		 234 aa  93.2  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  28.79 
 
 		 256 aa  93.2  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.74 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 270 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 252 aa  90.5  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3908  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 287 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.078228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 251 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 254 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 254 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 		 257 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 261 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.35 
 
 		 254 aa  89.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 265 aa  89.7  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 249 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 260 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 		 260 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  28.09 
 
 		 260 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 259 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 250 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  27.57 
 
 		 231 aa  87.4  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 267 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.72 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  24.45 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  23.91 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  30.73 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3028  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633181  normal  0.0348556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>