250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3334 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1591  family 2 glycosyl transferase  40 
 
 
281 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0274  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
298 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3040  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.679384  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.65 
 
 
293 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.65 
 
 
293 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.28 
 
 
295 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3832  glycosyl transferase family 2  38.99 
 
 
295 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3882  glycosyl transferase family 2  38.63 
 
 
295 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1077  putative glycosyltransferase  35.48 
 
 
276 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
310 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
310 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  33.22 
 
 
313 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
313 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
309 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
270 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
297 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
279 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
257 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
250 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3908  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.078228  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  33.7 
 
 
249 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
256 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
254 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
282 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
250 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
250 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0566  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
300 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277613  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
250 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.37 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  31.52 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  27.45 
 
 
231 aa  109  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
308 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.86 
 
 
254 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
256 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.31 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0563  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6295  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
290 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.31 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.31 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.92 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.31 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  33.08 
 
 
256 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  31.92 
 
 
254 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
255 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.92 
 
 
254 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
259 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5794  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
255 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
253 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
260 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
247 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
257 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
253 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  32.17 
 
 
259 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
250 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  32.17 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
249 aa  99  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  25.86 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
272 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4963  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601362  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0896  b-glycosyltransferase  30.15 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000325648  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.82 
 
 
234 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1404  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.77 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
261 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
265 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
257 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
249 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
254 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.96 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  24.82 
 
 
516 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25.18 
 
 
515 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
258 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  29.67 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  24.38 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.9 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
263 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.99 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  26.83 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>