More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0563 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0563  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1404  glycosyl transferase family 2  52.69 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 
287 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  38.25 
 
 
257 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  38.21 
 
 
259 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
260 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  37.4 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
234 aa  125  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  34.58 
 
 
259 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
256 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  31.97 
 
 
231 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  32.91 
 
 
249 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.6 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  30.17 
 
 
231 aa  116  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
247 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
258 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  30.57 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.2 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.64 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
257 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
254 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
257 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
253 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
292 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
257 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
310 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
310 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
257 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
263 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.08 
 
 
260 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  32.08 
 
 
260 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
260 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.96 
 
 
253 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
263 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  31.15 
 
 
256 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  27.48 
 
 
515 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.54 
 
 
254 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.54 
 
 
254 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.13 
 
 
254 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 
254 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.54 
 
 
254 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  29.06 
 
 
515 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.54 
 
 
254 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
250 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
252 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
258 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.68 
 
 
254 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
250 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
249 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  33.06 
 
 
267 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
250 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
251 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
250 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
250 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
250 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
254 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.99 
 
 
295 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
250 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  31.28 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  31.28 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.5 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
309 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.87 
 
 
252 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  28.4 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  27.92 
 
 
516 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  27.66 
 
 
254 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
267 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  28.19 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.92 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
875 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>