More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1193 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  79.77 
 
 		 431 aa  740    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 432 aa  890    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  66.28 
 
 		 434 aa  632  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 434 aa  431  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  289  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 479 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 464 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 462 aa  277  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 463 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 463 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 463 aa  269  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0824  asparaginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 481 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 466 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 466 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 466 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>