More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0152 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 347 aa  694    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1025  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.09 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.669152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1538  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.08 
 
 		 313 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0672252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1095  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.09 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.508014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 		 351 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.19 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.16 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 334 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.26 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 337 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.41 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.85 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 335 aa  381  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.31 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.17 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.29 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.92 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.12 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.44 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.12 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.49 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.49 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.33 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.68 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.85 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.12 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.25 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  52.74 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  54.46 
 
 		 341 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.49 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  55.38 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>