43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1272 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1272  hypothetical protein  100 
 
 
650 aa  1342    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3306  hypothetical protein  34.35 
 
 
694 aa  349  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0912335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  27.49 
 
 
846 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  61.11 
 
 
971 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  52.17 
 
 
967 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  61.11 
 
 
1018 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  58.33 
 
 
971 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  58.33 
 
 
971 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  53.85 
 
 
963 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  58.33 
 
 
971 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  58.33 
 
 
971 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  58.33 
 
 
971 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  63.64 
 
 
960 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  58.33 
 
 
971 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  63.64 
 
 
960 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  58.33 
 
 
960 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  51.28 
 
 
818 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  55.56 
 
 
971 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  50 
 
 
940 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  51.22 
 
 
965 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  37.33 
 
 
852 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  52.78 
 
 
971 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  48.72 
 
 
951 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  42.11 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.9 
 
 
1380 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  51.43 
 
 
658 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  51.22 
 
 
965 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  54.84 
 
 
1463 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  47.62 
 
 
669 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  51.43 
 
 
685 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  42.59 
 
 
918 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  43.14 
 
 
1231 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  50 
 
 
1095 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  51.43 
 
 
675 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  50 
 
 
965 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11488  serine protease, subtilase family protein  32.43 
 
 
312 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  51.22 
 
 
965 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  50 
 
 
995 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  48.65 
 
 
871 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  48.78 
 
 
965 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  48.65 
 
 
871 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  48.72 
 
 
2176 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.93 
 
 
1842 aa  43.9  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>