39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0798 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  100 
 
 
886 aa  1816    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  48.38 
 
 
1063 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  36.28 
 
 
742 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  36.55 
 
 
1093 aa  379  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  36 
 
 
709 aa  356  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  34.16 
 
 
852 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  36.34 
 
 
661 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  36.36 
 
 
734 aa  341  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  33.91 
 
 
667 aa  325  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  34.87 
 
 
886 aa  291  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  35.14 
 
 
891 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  29.27 
 
 
863 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  22.88 
 
 
998 aa  66.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.11 
 
 
775 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  25.28 
 
 
783 aa  64.3  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  23.83 
 
 
1008 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0344  peptidase domain-containing protein  28.87 
 
 
716 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.598712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  31.97 
 
 
644 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  34.62 
 
 
617 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  30.69 
 
 
659 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.36 
 
 
3299 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.46 
 
 
3419 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1999  Proprotein convertase P  32.2 
 
 
209 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.85 
 
 
3535 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.39 
 
 
836 aa  48.5  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  25.69 
 
 
1151 aa  48.5  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 
514 aa  48.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
835 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  32 
 
 
840 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  31.58 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0345  proprotein convertase P  26.4 
 
 
693 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 
835 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  29.35 
 
 
818 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.5 
 
 
3537 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
597 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  29.11 
 
 
1449 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  35.11 
 
 
1079 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 
835 aa  44.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  26.13 
 
 
768 aa  44.3  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>