27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4299 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  100 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  43.3 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  33.76 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  32.47 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  32.47 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  32.03 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  31.6 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  31.17 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  31.6 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  30.13 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  30.86 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  26.42 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  27.73 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  29.07 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  27.2 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  26.27 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  32.57 
 
 		 371 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  25.74 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  25.75 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  28.77 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  26.74 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  24.73 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  23.84 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  25.83 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  20.6 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  23.14 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  23.81 
 
 		 141 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>