41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4215 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
98 aa  205  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 
98 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 
98 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  49.48 
 
 
98 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 
98 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 
98 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  40 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  39.39 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  36.56 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
99 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  29.03 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  26.32 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  31.96 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  28.72 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  27.78 
 
 
103 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 
103 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 
103 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  28.12 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  32.29 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  29.29 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  29.47 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  24.21 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  28.42 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  27.47 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  30.1 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  27.47 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  26.6 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  30.68 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
99 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>