152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3179 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  97.65 
 
 
445 aa  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  75.53 
 
 
444 aa  681    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  100 
 
 
425 aa  889    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  61.94 
 
 
442 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  60.05 
 
 
442 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  59.81 
 
 
442 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  58.16 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.65 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  49.06 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.31 
 
 
444 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.22 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.94 
 
 
435 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  42.99 
 
 
438 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.13 
 
 
426 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.24 
 
 
442 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  38.95 
 
 
445 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.95 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.17 
 
 
452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.24 
 
 
434 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  38.14 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.22 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.35 
 
 
457 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.71 
 
 
505 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.93 
 
 
446 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  33.42 
 
 
427 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.68 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.24 
 
 
454 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  32.87 
 
 
442 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.57 
 
 
471 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.05 
 
 
431 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  32.3 
 
 
434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.03 
 
 
502 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  33.8 
 
 
462 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  32.13 
 
 
447 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.85 
 
 
428 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.65 
 
 
502 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.6 
 
 
428 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  32.6 
 
 
498 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.49 
 
 
432 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.83 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.07 
 
 
495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  30.83 
 
 
496 aa  223  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.13 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.41 
 
 
455 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.88 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.88 
 
 
501 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  30.21 
 
 
468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.64 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.43 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  29.07 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  29.07 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.07 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.88 
 
 
449 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.77 
 
 
458 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.44 
 
 
440 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.33 
 
 
442 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.31 
 
 
445 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.5 
 
 
463 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.22 
 
 
496 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.93 
 
 
456 aa  192  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.32 
 
 
442 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.34 
 
 
445 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.28 
 
 
442 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.27 
 
 
448 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  30.46 
 
 
443 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.28 
 
 
444 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.95 
 
 
455 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.12 
 
 
439 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.1 
 
 
439 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.67 
 
 
435 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.64 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  28.85 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  28.9 
 
 
444 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  27.46 
 
 
444 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  26.48 
 
 
456 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.25 
 
 
458 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.25 
 
 
458 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  27.46 
 
 
444 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.01 
 
 
458 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.42 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.29 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.42 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28.47 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  28.67 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.52 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.66 
 
 
458 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.48 
 
 
445 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.19 
 
 
454 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.78 
 
 
422 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.03 
 
 
452 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  29.29 
 
 
443 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.33 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  26.62 
 
 
498 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  26.24 
 
 
456 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  26.74 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  26.67 
 
 
453 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.8 
 
 
444 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  27.91 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.87 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  27.67 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>