More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1891 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  83.74 
 
 		 486 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  94.44 
 
 		 486 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  99.59 
 
 		 486 aa  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  83.54 
 
 		 486 aa  875    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  75.72 
 
 		 486 aa  781    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  81.07 
 
 		 486 aa  842    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  65.49 
 
 		 483 aa  660    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  94.44 
 
 		 486 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  82.3 
 
 		 486 aa  853    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  83.54 
 
 		 486 aa  875    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  94.44 
 
 		 486 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 486 aa  997    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  94.44 
 
 		 486 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  81.28 
 
 		 486 aa  844    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  94.44 
 
 		 486 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  99.59 
 
 		 486 aa  994    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  75.93 
 
 		 486 aa  793    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  93.62 
 
 		 486 aa  951    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  51.85 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  52.06 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  50.2 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  50.62 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  50.21 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  49.08 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  47.85 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  48.87 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  44.16 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  41.68 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  41.97 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 		 555 aa  317  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0865  cardiolipin synthetase  33.57 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000163382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  34.5 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  33.48 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  33.54 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  34.43 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  33.47 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  34.91 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  34.05 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  34.05 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  34.07 
 
 		 482 aa  246  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 		 491 aa  242  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.07 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  34.22 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.49 
 
 		 472 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.32 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.22 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.03 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.48 
 
 		 514 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.04 
 
 		 481 aa  230  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.96 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.76 
 
 		 514 aa  228  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  32.49 
 
 		 491 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.53 
 
 		 514 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  32.53 
 
 		 472 aa  223  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  29.46 
 
 		 489 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.56 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.52 
 
 		 526 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  29.08 
 
 		 486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.75 
 
 		 541 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.63 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 505 aa  210  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  27.45 
 
 		 505 aa  210  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  30.15 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.42 
 
 		 481 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  26.92 
 
 		 490 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.57 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.57 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  28.6 
 
 		 473 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  27.57 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.36 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  27.57 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  29.61 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.25 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  30.37 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.42 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.36 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.42 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.72 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  27.42 
 
 		 509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  27.42 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  29.04 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.54 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  31.65 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>