More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0242 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  98.42 
 
 		 379 aa  762    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 		 379 aa  773    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.73 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  50 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.73 
 
 		 377 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.87 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.9 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  43.31 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.63 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.95 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.35 
 
 		 379 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.11 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.34 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.96 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.6 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.67 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.89 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.23 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.52 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.3 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.27 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.54 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.96 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.28 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.65 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.5 
 
 		 387 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.8 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.76 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.79 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.8 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.5 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.83 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.5 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.76 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.23 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.47 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.94 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.95 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.59 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.84 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.86 
 
 		 378 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3077  flagellar biosynthesis protein  36.6 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.87 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.38 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.96 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  37.89 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.73 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.68 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.07 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.73 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.1 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.02 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.06 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.81 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.84 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.48 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.78 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.84 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.39 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.69 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.08 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.12 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.55 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.81 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.41 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.75 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.15 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.59 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  33.78 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1618  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.44 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.48 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.78 
 
 		 376 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  35.81 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.24 
 
 		 391 aa  209  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  36.15 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.15 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>