More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3077 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3077  flagellar biosynthesis protein  100 
 
 
387 aa  777    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1618  flagellar biosynthetic protein FlhB  58.33 
 
 
385 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3706  type III secretion exporter  48.29 
 
 
385 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  45.76 
 
 
390 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  47.04 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  47.04 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0600  type III secretion exporter  47.58 
 
 
391 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.87 
 
 
392 aa  296  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.6 
 
 
390 aa  292  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.79 
 
 
381 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
380 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0932  type III secretion exporter  45.09 
 
 
387 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.82 
 
 
380 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.35 
 
 
378 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.9 
 
 
383 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.62 
 
 
398 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.08 
 
 
378 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.15 
 
 
381 aa  276  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.44 
 
 
406 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.37 
 
 
387 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.9 
 
 
383 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.64 
 
 
383 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.64 
 
 
383 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.86 
 
 
383 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.64 
 
 
383 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.64 
 
 
383 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  40.37 
 
 
402 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.64 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.27 
 
 
378 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.15 
 
 
399 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
382 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.36 
 
 
399 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.36 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.36 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.93 
 
 
399 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.88 
 
 
399 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.74 
 
 
379 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.52 
 
 
378 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.28 
 
 
383 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.01 
 
 
379 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.53 
 
 
380 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.89 
 
 
391 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.68 
 
 
382 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 
377 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.15 
 
 
387 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
401 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.15 
 
 
387 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.17 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.71 
 
 
405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.98 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.3 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.3 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.07 
 
 
377 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.17 
 
 
386 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 
383 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.12 
 
 
378 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.39 
 
 
378 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.12 
 
 
376 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  37 
 
 
377 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.17 
 
 
377 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.47 
 
 
384 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.32 
 
 
378 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 
376 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.19 
 
 
376 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.48 
 
 
382 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.91 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.48 
 
 
382 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.48 
 
 
382 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.91 
 
 
376 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  39.22 
 
 
382 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.22 
 
 
382 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.22 
 
 
382 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  39.22 
 
 
382 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 
376 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.64 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.25 
 
 
411 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 
376 aa  245  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.79 
 
 
377 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.7 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  40.16 
 
 
387 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.76 
 
 
376 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
376 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.15 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.47 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.15 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.51 
 
 
377 aa  239  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.66 
 
 
377 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.26 
 
 
390 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.5 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  36.15 
 
 
375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.63 
 
 
383 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
379 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.6 
 
 
379 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>