More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1618 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1618  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 
385 aa  774    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3077  flagellar biosynthesis protein  58.33 
 
 
387 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3706  type III secretion exporter  48.93 
 
 
385 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  47.53 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  48.56 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  48.56 
 
 
390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0600  type III secretion exporter  46.15 
 
 
391 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0932  type III secretion exporter  45.67 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.9 
 
 
381 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.01 
 
 
383 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.01 
 
 
383 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.23 
 
 
382 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.01 
 
 
383 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.01 
 
 
383 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.74 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.53 
 
 
390 aa  271  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.11 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.33 
 
 
382 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.33 
 
 
382 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  43.33 
 
 
382 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  43.33 
 
 
382 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.33 
 
 
382 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.33 
 
 
382 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.36 
 
 
383 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.33 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.08 
 
 
382 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.36 
 
 
387 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 
398 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.48 
 
 
378 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.1 
 
 
383 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  40 
 
 
379 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.22 
 
 
392 aa  255  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.48 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.67 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.86 
 
 
380 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.22 
 
 
376 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.34 
 
 
386 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.99 
 
 
377 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.22 
 
 
390 aa  249  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.11 
 
 
380 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.07 
 
 
386 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.41 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.33 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.93 
 
 
379 aa  245  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.56 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.25 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.34 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.34 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.76 
 
 
406 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.08 
 
 
399 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  39 
 
 
376 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.9 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.3 
 
 
403 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.63 
 
 
383 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.27 
 
 
382 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.27 
 
 
382 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
377 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.58 
 
 
399 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.2 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.62 
 
 
379 aa  235  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.1 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.51 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.2 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.96 
 
 
405 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.96 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.03 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.96 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.96 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.17 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.96 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.93 
 
 
399 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
401 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  36.53 
 
 
402 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
401 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.03 
 
 
376 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.17 
 
 
377 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.23 
 
 
379 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
380 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.62 
 
 
387 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.62 
 
 
387 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.64 
 
 
405 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.3 
 
 
376 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 
376 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.67 
 
 
382 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 
380 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.04 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 
380 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.81 
 
 
411 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 
376 aa  225  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 
377 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 
380 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 
376 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  34.31 
 
 
375 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 
376 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.49 
 
 
376 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.51 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 
375 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.7 
 
 
383 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.39 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>