36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0042 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  299  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  40.58 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  42.55 
 
 
151 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  35.42 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  32.41 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  35.4 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  32.37 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  32.33 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  32.88 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  36.09 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  41.79 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  30.6 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.06 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  30.41 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  31.39 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  33.11 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  31.13 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  30.53 
 
 
137 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.33 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  29.2 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  29.41 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  30.3 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.5 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  28.89 
 
 
132 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  30.3 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  28.57 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>