33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3542 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  81.67 
 
 		 240 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  40.79 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  50 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  43.5 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  43.22 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1250  hypothetical protein  67.71 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000878472  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  33.05 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  33.47 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  33.47 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  40.27 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  40.27 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3775  hypothetical protein  35.65 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361227  hitchhiker  0.000220505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  42.42 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  39.01 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  32.11 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  36.69 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  36.69 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  36.69 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  36.69 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  39.84 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  33.76 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  33.56 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  33.08 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  29.29 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  29.65 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  34.75 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1227  hypothetical protein  34.82 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.581429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  31.2 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  21.77 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  32.97 
 
 		 88 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  25.37 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  25.37 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>