49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1435 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  80.83 
 
 		 247 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  80.83 
 
 		 247 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  33.19 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  33.05 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  52.69 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  29.88 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  31.91 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  50 
 
 		 88 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  39.39 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  37.8 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  38.1 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  35.57 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  38.1 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  38.1 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  40.65 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  38.1 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  38.1 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  28.25 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  37.69 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  33.77 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  32.43 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  39.47 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  39.23 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  31.67 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2275  phage antirepressor protein  42.31 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  26.18 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  45.45 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  26.62 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  30.43 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  27.33 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  31.25 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  25 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  32.61 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1250  hypothetical protein  33.8 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000878472  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3775  hypothetical protein  22.11 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361227  hitchhiker  0.000220505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  30.65 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  29.75 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  29.13 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  29.75 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  37.74 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  27.78 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  32.5 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  32.5 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>