25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3395 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  59.19 
 
 		 236 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  40.31 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  36.16 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  37.44 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  59 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  30 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  29.65 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  34.78 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  26.34 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  41.86 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  41.86 
 
 		 88 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  28.84 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  26.05 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  26.05 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  32.81 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  26.55 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  26.54 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  33.09 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  75 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  30.23 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  28.35 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  34.86 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0368  hypothetical protein  64.52 
 
 		 125 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2848  hypothetical protein  64.52 
 
 		 126 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>