46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0306 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  80.83 
 
 
243 aa  387  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  35.12 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  33.06 
 
 
240 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  35.19 
 
 
222 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  50.54 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  33.05 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  41.67 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  41.6 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  40.32 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  40.32 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  50 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  38.94 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  38.94 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  38.94 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  38.94 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  29.57 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2275  phage antirepressor protein  27.42 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  35.37 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  27.42 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  32.87 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  45.45 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  26.38 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  30.26 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  35.87 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  34.58 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3775  hypothetical protein  24.74 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361227  hitchhiker  0.000220505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  29.7 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  37.5 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  34.95 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  38.54 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  32.68 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  31.78 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  29.57 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  29.57 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0368  hypothetical protein  47.62 
 
 
125 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  33.06 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  27.92 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2848  hypothetical protein  47.62 
 
 
126 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1250  hypothetical protein  33.93 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000878472  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  27.94 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  31.76 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  29.79 
 
 
194 aa  42  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>