30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1027 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  27.97 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  30.34 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  33.33 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  31.96 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  28.12 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  29.38 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  31.96 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  29.29 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  30.88 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  31.68 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  30.33 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  25 
 
 		 188 aa  52.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  32.32 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  25.66 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  29.47 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  31.46 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  25.56 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  28.18 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  28.46 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  30.21 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  25.48 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  25.53 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  25.37 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  28.32 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  37.14 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  31.43 
 
 		 91 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>