48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0879 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  48.98 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  48.98 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  47.76 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  47.76 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  50 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  36.36 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  49.65 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  48.94 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  44.3 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  44.7 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  30.83 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  30.83 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  33.93 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  39.72 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  39.01 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  45.87 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  45.36 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  32.51 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  39.37 
 
 		 383 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  34.56 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  39.23 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  41 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  35.48 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  37.4 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  38.52 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  32.62 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  37.16 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  33.83 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  41.3 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  40.91 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  40.38 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  40.38 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  34.17 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  38.78 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  37.23 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  33.06 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  37.96 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  30.82 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  35.92 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  27.84 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2275  phage antirepressor protein  33.11 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  35.37 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  31.5 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  31.5 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  30.89 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>