25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1690 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  58.93 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  69.35 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  49.66 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  38.28 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  32.16 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  34.54 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  32.11 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  28.38 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  29.07 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  48.89 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  28.25 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  25.3 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  29.83 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  27.83 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  27.83 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  26.97 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  33.06 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  32.67 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  41.18 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  39.22 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  39.22 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3775  hypothetical protein  27.81 
 
 		 271 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361227  hitchhiker  0.000220505 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  36.92 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  27.27 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>