43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1680 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  100 
 
 
239 aa  495  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  51.9 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  51.9 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  48.95 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  48.95 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  50 
 
 
257 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  63.89 
 
 
260 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  56.34 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  56.34 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  52.67 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  36.96 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  36.96 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  35.86 
 
 
266 aa  125  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  35.86 
 
 
266 aa  125  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  34.44 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  45.53 
 
 
182 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  36.02 
 
 
249 aa  99  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  45.16 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  34.75 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  41.53 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  44.83 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  35.56 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  34.78 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  39.53 
 
 
291 aa  72  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  34.71 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  32.97 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  40.54 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  33.56 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  35 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  39.25 
 
 
383 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  38.83 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  33.77 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  29.25 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  36.61 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  37.04 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  37.04 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  28.37 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  32.09 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  30.49 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2275  phage antirepressor protein  34.55 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  30.22 
 
 
283 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  30.22 
 
 
283 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  29.73 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>