22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6402 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  100 
 
 		 88 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  50 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  46.59 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  50 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  50 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  48.15 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  44.58 
 
 		 255 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  48.89 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  41.86 
 
 		 249 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2848  hypothetical protein  55 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  40.91 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  43.18 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0368  hypothetical protein  51.67 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  38.64 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  34.83 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  35.87 
 
 		 227 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  29.59 
 
 		 245 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0669  hypothetical protein  35.59 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000063382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  32.97 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  28.57 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0440  hypothetical protein  44.68 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3775  hypothetical protein  33.73 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361227  hitchhiker  0.000220505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>