22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2481 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  531  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  36 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0402  hypothetical protein  46.32 
 
 		 145 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  33.48 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  30.93 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  43.27 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  29.07 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  44.58 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  39.02 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  47.06 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  47.06 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  37.69 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  42.53 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0368  hypothetical protein  46.27 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  30.88 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2848  hypothetical protein  41.77 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  21.77 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  25.97 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  26.42 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  37.14 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  37.14 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  22.08 
 
 		 241 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>