32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0817 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  49.18 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  31.91 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  28.38 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  33.05 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  33.05 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  29.29 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  27.8 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  36.29 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  38.78 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  29.83 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  33.59 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  29.25 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  35 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  35 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  35 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  35 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  31.69 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  33.91 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  31.69 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  31.47 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  38.46 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  31.58 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  35.87 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  31.13 
 
 		 380 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  24.82 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  24.82 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  29.41 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  27.46 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  33.33 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  22.08 
 
 		 255 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>