42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0420 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  46.9 
 
 
236 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  43.36 
 
 
233 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  32.74 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  33.85 
 
 
252 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  44.85 
 
 
259 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  36.54 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  36.79 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  36.89 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  30.43 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  31.43 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  31.01 
 
 
380 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  32.76 
 
 
188 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  32.28 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  33 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  33.64 
 
 
194 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  31.93 
 
 
188 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  28.7 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  24.62 
 
 
207 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  28.57 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  28.8 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  29.92 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  29.25 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  30.56 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  30.56 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  27.64 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  24.8 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  33.75 
 
 
165 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  28.1 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  28 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  26.85 
 
 
172 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  34.33 
 
 
128 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  28.81 
 
 
167 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  32.89 
 
 
72 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  24.82 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  30.17 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  24.44 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  30 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  30 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  26.77 
 
 
184 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>