46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2286 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  100 
 
 		 380 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  61.51 
 
 		 282 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  54.12 
 
 		 284 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  42.86 
 
 		 207 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  50.91 
 
 		 172 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  49.19 
 
 		 200 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  50.98 
 
 		 227 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  53.19 
 
 		 243 aa  106  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  49.07 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  55.06 
 
 		 167 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  40.87 
 
 		 184 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  45.28 
 
 		 194 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  45.28 
 
 		 194 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  40 
 
 		 179 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  43.93 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  41.49 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  44.9 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  41.07 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  41.07 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  38.24 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  40.74 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  52.11 
 
 		 165 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.62 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  44.12 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  54.41 
 
 		 72 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  38.32 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  32.8 
 
 		 204 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  46.38 
 
 		 91 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  48.39 
 
 		 128 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  35.16 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  33.94 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  30.89 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  32.98 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3549  prophage protein  47.73 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3708  prophage protein  47.73 
 
 		 179 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  31.01 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  31.01 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  32.48 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  52.46 
 
 		 110 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  29.29 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  29.29 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  29.94 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  31.13 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  40 
 
 		 131 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  31.65 
 
 		 183 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>