More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1013 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
244 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  68.05 
 
 
244 aa  325  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  62.39 
 
 
245 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  43.05 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 
238 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  33.48 
 
 
256 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  33.18 
 
 
269 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  30.37 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.6 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  32.07 
 
 
257 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 
275 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 
245 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  29.69 
 
 
244 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  31.36 
 
 
263 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 
246 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  29.74 
 
 
261 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.52 
 
 
257 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  28.86 
 
 
295 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  29.76 
 
 
279 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  26.51 
 
 
267 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.32 
 
 
271 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 
253 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  34.32 
 
 
266 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  28.57 
 
 
288 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  29.49 
 
 
261 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  28.74 
 
 
295 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  29.49 
 
 
261 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 
268 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  34.46 
 
 
292 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  29.74 
 
 
243 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  28.87 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  29.18 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  26.32 
 
 
286 aa  98.6  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  29.92 
 
 
281 aa  98.2  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  30.68 
 
 
296 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  29.06 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  31.03 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  27.16 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  31.07 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  27.16 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  29.44 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  29.57 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  32.73 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  27.31 
 
 
285 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 
280 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  26.86 
 
 
253 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  26.75 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  29.69 
 
 
272 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.39 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  27.53 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  23.53 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  26.75 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  24.89 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  26.38 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  27.35 
 
 
285 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  27.83 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27.83 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  30.87 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  29.17 
 
 
259 aa  92  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  26.91 
 
 
285 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.09 
 
 
338 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  27.27 
 
 
296 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  29.17 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.77 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  26.98 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  29.46 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  29.29 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  25.93 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 
266 aa  89.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1716  chemotaxis protein PomB  32.26 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.81071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.13 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  26.25 
 
 
342 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  24.6 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 
257 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  26.24 
 
 
295 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  27.63 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.86 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.2 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2180  OmpA/MotB domain protein  27.31 
 
 
235 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.736201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  37.5 
 
 
343 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  40.16 
 
 
525 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  38.33 
 
 
343 aa  85.1  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  38.1 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  40.68 
 
 
342 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  28.17 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  23.72 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  24.57 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  26.99 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  24.24 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 
305 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  29.57 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>