More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1868 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 716 aa  1487    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  47.21 
 
 		 714 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  70.67 
 
 		 712 aa  1066    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  66.57 
 
 		 716 aa  1014    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  76.4 
 
 		 713 aa  1127    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  84.38 
 
 		 717 aa  1288    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  66.99 
 
 		 717 aa  1056    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  59.11 
 
 		 721 aa  906    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  44.38 
 
 		 708 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  44.27 
 
 		 717 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  43.97 
 
 		 730 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  43.84 
 
 		 711 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  44.54 
 
 		 711 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  44.26 
 
 		 711 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  42.1 
 
 		 712 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  42.16 
 
 		 710 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  38.54 
 
 		 767 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.69 
 
 		 722 aa  363  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.61 
 
 		 470 aa  311  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  36.13 
 
 		 470 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  38.27 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  35.61 
 
 		 469 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  36.62 
 
 		 469 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  37.15 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  38.96 
 
 		 471 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  35.9 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  39.22 
 
 		 471 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.68 
 
 		 470 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  35.47 
 
 		 470 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  36.12 
 
 		 470 aa  300  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.47 
 
 		 470 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  35.41 
 
 		 470 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 470 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 470 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  35.17 
 
 		 481 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 482 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  39.26 
 
 		 489 aa  295  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  37.95 
 
 		 477 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  44.24 
 
 		 470 aa  293  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  37.95 
 
 		 477 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  36.54 
 
 		 475 aa  293  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 		 481 aa  293  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  37.53 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  37.71 
 
 		 482 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  38.28 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  39.56 
 
 		 470 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  43.81 
 
 		 470 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  43.81 
 
 		 470 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  37.29 
 
 		 482 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  39.04 
 
 		 472 aa  291  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.68 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  37.68 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  37.68 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.68 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.68 
 
 		 536 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  37.68 
 
 		 483 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  31.15 
 
 		 741 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  37.44 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  37.2 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  35.13 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  37.12 
 
 		 481 aa  288  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  39.58 
 
 		 479 aa  287  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  35.93 
 
 		 490 aa  288  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  39.6 
 
 		 465 aa  287  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  38.85 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  37.14 
 
 		 481 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  40.58 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  39.47 
 
 		 476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  40.7 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  37.41 
 
 		 481 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 		 463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 		 464 aa  285  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 		 473 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 		 481 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.05 
 
 		 475 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  30.18 
 
 		 738 aa  281  4e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  35.77 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  36.07 
 
 		 479 aa  280  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  30.89 
 
 		 727 aa  280  9e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 475 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  36.43 
 
 		 475 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  36.26 
 
 		 470 aa  279  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  38.79 
 
 		 486 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  39.07 
 
 		 475 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  36.93 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 475 aa  278  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  36.43 
 
 		 475 aa  278  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 475 aa  278  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  40.88 
 
 		 456 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  36.64 
 
 		 472 aa  277  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  36.18 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  36.18 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  36.18 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  37.31 
 
 		 470 aa  276  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  41.82 
 
 		 480 aa  276  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  34.75 
 
 		 480 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.11 
 
 		 480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  34.61 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>