More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1568 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1568  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
224 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2545  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.11 
 
 
224 aa  345  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.440853  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0183  amino acid ABC transporter permease  69.09 
 
 
225 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.13 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1761  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.18 
 
 
222 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.99 
 
 
224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.468952  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
226 aa  228  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1435  hypothetical protein  51.39 
 
 
255 aa  209  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0028  amino acid ABC transporter permease  49.08 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1364  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.54 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.797518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1800  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.38 
 
 
224 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.99477  normal  0.0316116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2181  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 
308 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18740  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.18 
 
 
222 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.110609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 
213 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.59 
 
 
219 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  42.25 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1689  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
338 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679446  normal  0.715354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0122  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
339 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.81 
 
 
219 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  41.04 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.86 
 
 
219 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
226 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
225 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
225 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3547  amino acid ABC transproter permease protein  36.07 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.443422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3549  amino acid ABC transproter permease protein  36.07 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 
225 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
223 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 
239 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.21 
 
 
216 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
221 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3235  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 
222 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0692  amino acid ABC transporter permease  38.03 
 
 
222 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194775  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
219 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0330968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
219 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
223 aa  141  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000259788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2032  amino acid ABC transporter permease  38.69 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  33.8 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  33.8 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  33.8 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0173  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0340147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  33.8 
 
 
232 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
227 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
221 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
226 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  36.73 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  38.46 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  38.86 
 
 
230 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  37.74 
 
 
222 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  38.14 
 
 
222 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.61 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 
236 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
215 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
228 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
225 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.41 
 
 
220 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.1 
 
 
493 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
209 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4694  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
230 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586539  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
216 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 
274 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
218 aa  137  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1680  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
230 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0758513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2074  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.68 
 
 
227 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
230 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 
226 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.120537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  43.37 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0218  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2526  amino acid ABC transporter permease  39.53 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1528  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
216 aa  135  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0357  amino acid ABC transporter permease  42.94 
 
 
222 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
220 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0185  amino acid ABC transporter permease  34.27 
 
 
222 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002011  amino acid ABC transporter permease protein  35 
 
 
223 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
259 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
259 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
222 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0724  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  42.77 
 
 
222 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>