88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0832 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  76.14 
 
 		 88 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0920  hypothetical protein  68.18 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0973  hypothetical protein  68.18 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0952  hypothetical protein  67.05 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0889  hypothetical protein  67.05 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0861  hypothetical protein  65.91 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.36 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  60.23 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1292  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0645642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  60.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0690  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64410  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5590  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2947  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  58.62 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0176  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00392065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  55.68 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1167  hypothetical protein  59.09 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0374  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3428  hypothetical protein  60.23 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2397  hypothetical protein  55.68 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1359  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.68 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2983  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000187823  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2120  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.40904  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0268  hypothetical protein  55.68 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  58.75 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0566  hypothetical protein  52.22 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118143 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0847  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0030  conjugal transfer protein TraR  49.02 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00565405  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  44.07 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.1 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.1 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  47.92 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3778  TraR/DksA family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.563726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1348  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0302261  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1677  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  67.74 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3840  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.94 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3507  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119963  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1959  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.94 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0951  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.748618  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3162  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0609  transcriptional regulator, TraR/DksA family  66.67 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3059  DksA/TraR family protein  38.98 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386172  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2877  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  38.98 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0666  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.63 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3183  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.88 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2705  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00476822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2922  TraR/DksA family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.319958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07970  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  2.71217e-16  hitchhiker  0.000634076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  64.29 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  41.82 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  46.94 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  36.54 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0756  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0374591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2519  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  58.82 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  58.82 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0875  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0418872  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00494  hypothetical protein  58.06 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00488  conserved hypothetical protein  58.06 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.22 
 
 		 150 aa  40  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 115 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>