64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1167 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  180  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64410  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5590  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0176  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00392065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0690  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  62.92 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2983  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000187823  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  60.23 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2397  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  60.67 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  59.55 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  59.55 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  59.55 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.55 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  59.55 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  59.55 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2120  hypothetical protein  55.68 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.40904  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0374  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  58.43 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2947  hypothetical protein  59.09 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  58.43 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  55.68 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0268  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3428  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  57.95 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0861  hypothetical protein  57.95 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1359  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.55 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1292  hypothetical protein  55.68 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0645642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0920  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0973  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0889  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0952  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  53.41 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0566  hypothetical protein  53.93 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  54.43 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  50.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0847  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  51.02 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3162  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2877  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  41.79 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3059  DksA/TraR family protein  41.79 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386172  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  54.76 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  54.76 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.98 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  41.79 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1348  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0302261  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00565405  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.7 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3840  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  42.86 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3778  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.563726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  35.29 
 
 		 75 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3507  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119963  normal  0.0323819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>